MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015508	ACAA	2	8	75313	75320	75 %	0 %	0 %	25 %	332715444
1502	NC_015508	AGG	2	6	75494	75499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715445
1503	NC_015508	CGG	2	6	75537	75542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715445
1504	NC_015508	TGC	2	6	75641	75646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715445
1505	NC_015508	CCGG	2	8	75687	75694	0 %	0 %	50 %	50 %	332715445
1506	NC_015508	AAG	2	6	75745	75750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715445
1507	NC_015508	GGC	2	6	75775	75780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715445
1508	NC_015508	CAG	3	9	75781	75789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715445
1509	NC_015508	CT	3	6	75807	75812	0 %	50 %	0 %	50 %	332715445
1510	NC_015508	AACC	2	8	75845	75852	50 %	0 %	0 %	50 %	332715445
1511	NC_015508	TGGCC	2	10	75900	75909	0 %	20 %	40 %	40 %	332715445
1512	NC_015508	CTT	2	6	75984	75989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715445
1513	NC_015508	AGA	2	6	76023	76028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715445
1514	NC_015508	CGA	3	9	76129	76137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_015508	GAT	2	6	76154	76159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_015508	GGT	2	6	76169	76174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015508	GGC	2	6	76207	76212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_015508	CGC	2	6	76231	76236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_015508	CGC	2	6	76244	76249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_015508	ACA	2	6	76291	76296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_015508	ACA	2	6	76319	76324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_015508	GCA	2	6	76370	76375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_015508	CAA	2	6	76547	76552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_015508	CCA	2	6	76554	76559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_015508	GC	3	6	76667	76672	0 %	0 %	50 %	50 %	332715446
1526	NC_015508	CGT	2	6	76758	76763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715446
1527	NC_015508	ACT	2	6	76769	76774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715446
1528	NC_015508	GC	3	6	76818	76823	0 %	0 %	50 %	50 %	332715446
1529	NC_015508	TGC	2	6	76859	76864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715446
1530	NC_015508	CATATC	2	12	76929	76940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715446
1531	NC_015508	ATG	3	9	76944	76952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715446
1532	NC_015508	GA	3	6	76980	76985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_015508	CTGG	2	8	77141	77148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_015508	AGA	2	6	77194	77199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715447
1535	NC_015508	CCG	2	6	77266	77271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715447
1536	NC_015508	GCA	2	6	77312	77317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715447
1537	NC_015508	A	6	6	77375	77380	100 %	0 %	0 %	0 %	332715447
1538	NC_015508	CAA	2	6	77409	77414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715448
1539	NC_015508	TCA	2	6	77429	77434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715448
1540	NC_015508	GCT	2	6	77467	77472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715448
1541	NC_015508	GT	3	6	77522	77527	0 %	50 %	50 %	0 %	332715448
1542	NC_015508	GCG	2	6	77549	77554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715448
1543	NC_015508	G	6	6	77574	77579	0 %	0 %	100 %	0 %	332715448
1544	NC_015508	AGG	2	6	77729	77734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715448
1545	NC_015508	ACCA	2	8	77754	77761	50 %	0 %	0 %	50 %	332715448
1546	NC_015508	CGA	2	6	77798	77803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715448
1547	NC_015508	GATC	2	8	77835	77842	25 %	25 %	25 %	25 %	332715448
1548	NC_015508	TAA	2	6	77890	77895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_015508	C	6	6	77951	77956	0 %	0 %	0 %	100 %	332715449
1550	NC_015508	CG	3	6	77961	77966	0 %	0 %	50 %	50 %	332715449
1551	NC_015508	GA	3	6	78014	78019	50 %	0 %	50 %	0 %	332715449
1552	NC_015508	GC	3	6	78073	78078	0 %	0 %	50 %	50 %	332715449
1553	NC_015508	GCC	2	6	78107	78112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715449
1554	NC_015508	TCG	2	6	78149	78154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715449
1555	NC_015508	TTCCG	2	10	78292	78301	0 %	40 %	20 %	40 %	332715449
1556	NC_015508	TGC	2	6	78339	78344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715449
1557	NC_015508	CG	3	6	78422	78427	0 %	0 %	50 %	50 %	332715449
1558	NC_015508	GCT	2	6	78435	78440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715449
1559	NC_015508	T	6	6	78500	78505	0 %	100 %	0 %	0 %	332715449
1560	NC_015508	ATA	2	6	78520	78525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_015508	GAGT	2	8	78533	78540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_015508	ATTAA	2	10	78564	78573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_015508	CGG	2	6	78627	78632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715450
1564	NC_015508	GCG	2	6	78660	78665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715450
1565	NC_015508	GCG	2	6	78718	78723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715450
1566	NC_015508	GCA	2	6	78746	78751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715450
1567	NC_015508	CGA	2	6	78780	78785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715450
1568	NC_015508	GGC	2	6	78939	78944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715450
1569	NC_015508	GCG	2	6	78945	78950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715450
1570	NC_015508	TTATCG	2	12	78971	78982	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332715450
1571	NC_015508	TGCCGG	2	12	79004	79015	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332715450
1572	NC_015508	GC	3	6	79060	79065	0 %	0 %	50 %	50 %	332715450
1573	NC_015508	GCCCG	2	10	79116	79125	0 %	0 %	40 %	60 %	332715450
1574	NC_015508	GGA	2	6	79209	79214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715450
1575	NC_015508	TGG	2	6	79226	79231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715450
1576	NC_015508	CGAT	2	8	79280	79287	25 %	25 %	25 %	25 %	332715450
1577	NC_015508	CGC	2	6	79399	79404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_015508	GCCT	2	8	79480	79487	0 %	25 %	25 %	50 %	332715451
1579	NC_015508	GCCT	2	8	79499	79506	0 %	25 %	25 %	50 %	332715451
1580	NC_015508	CGAG	2	8	79597	79604	25 %	0 %	50 %	25 %	332715451
1581	NC_015508	CAA	2	6	79714	79719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715451
1582	NC_015508	CGG	2	6	79801	79806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715451
1583	NC_015508	GC	3	6	79845	79850	0 %	0 %	50 %	50 %	332715451
1584	NC_015508	TGT	2	6	79864	79869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715451
1585	NC_015508	GTGG	2	8	79880	79887	0 %	25 %	75 %	0 %	332715451
1586	NC_015508	GATG	2	8	79955	79962	25 %	25 %	50 %	0 %	332715451
1587	NC_015508	GGT	2	6	79973	79978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715451
1588	NC_015508	GCC	2	6	80016	80021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715451
1589	NC_015508	GCC	2	6	80046	80051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715451
1590	NC_015508	CAT	3	9	80129	80137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715451
1591	NC_015508	TCG	2	6	80184	80189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715452
1592	NC_015508	CCG	2	6	80285	80290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715452
1593	NC_015508	CTGC	2	8	80349	80356	0 %	25 %	25 %	50 %	332715452
1594	NC_015508	GC	3	6	80355	80360	0 %	0 %	50 %	50 %	332715452
1595	NC_015508	TCC	2	6	80381	80386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715452
1596	NC_015508	CTG	2	6	80402	80407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715452
1597	NC_015508	AGA	2	6	80414	80419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715452
1598	NC_015508	CG	3	6	80457	80462	0 %	0 %	50 %	50 %	332715452
1599	NC_015508	ACC	2	6	80525	80530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715452
1600	NC_015508	GCCT	2	8	80584	80591	0 %	25 %	25 %	50 %	332715452
1601	NC_015508	CGCA	2	8	80605	80612	25 %	0 %	25 %	50 %	332715452
1602	NC_015508	ATA	2	6	80730	80735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_015508	GGC	2	6	80744	80749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_015508	T	6	6	80772	80777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015508	AACC	2	8	80834	80841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_015508	ATC	2	6	80890	80895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715453
1607	NC_015508	CCG	2	6	80915	80920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715453
1608	NC_015508	GCA	2	6	80926	80931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715453
1609	NC_015508	ACC	2	6	81107	81112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715453
1610	NC_015508	TGC	2	6	81141	81146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715453
1611	NC_015508	TGT	2	6	81195	81200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715453
1612	NC_015508	CAG	2	6	81215	81220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715453
1613	NC_015508	GCC	3	9	81352	81360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715453
1614	NC_015508	CAG	2	6	81433	81438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715453
1615	NC_015508	GGC	2	6	81532	81537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715453
1616	NC_015508	GCC	2	6	81556	81561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715453
1617	NC_015508	CGG	2	6	81612	81617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715453
1618	NC_015508	TTC	2	6	81656	81661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715453
1619	NC_015508	GGCC	2	8	81729	81736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_015508	TTTA	2	8	81740	81747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_015508	TTG	2	6	81789	81794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015508	GTC	2	6	81807	81812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_015508	CCG	2	6	81870	81875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_015508	CAC	2	6	81936	81941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_015508	G	6	6	82095	82100	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_015508	ATG	2	6	82102	82107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715454
1627	NC_015508	AGT	2	6	82365	82370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715454
1628	NC_015508	CAA	2	6	82407	82412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715454
1629	NC_015508	CGA	2	6	82440	82445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715454
1630	NC_015508	TCG	2	6	82538	82543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715454
1631	NC_015508	GTC	2	6	82567	82572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715454
1632	NC_015508	TCC	2	6	82639	82644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715454
1633	NC_015508	GAC	2	6	82767	82772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715454
1634	NC_015508	AGG	2	6	82815	82820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715454
1635	NC_015508	GCA	2	6	82829	82834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715454
1636	NC_015508	AAACC	2	10	82868	82877	60 %	0 %	0 %	40 %	332715454
1637	NC_015508	ATCA	2	8	82888	82895	50 %	25 %	0 %	25 %	332715454
1638	NC_015508	TTG	2	6	82964	82969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715454
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1642	NC_015508	CCGG	2	8	83122	83129	0 %	0 %	50 %	50 %	332715454
1643	NC_015508	CGA	2	6	83147	83152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715454
1644	NC_015508	GCG	2	6	83255	83260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715454
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1648	NC_015508	CAC	2	6	83528	83533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715454
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1651	NC_015508	GGC	2	6	83751	83756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715454
1652	NC_015508	GCC	3	9	83769	83777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715454
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1655	NC_015508	CCG	2	6	83912	83917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715454
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1658	NC_015508	CAA	2	6	83994	83999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715454
1659	NC_015508	ACG	2	6	84022	84027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715454
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1662	NC_015508	GT	3	6	84443	84448	0 %	50 %	50 %	0 %	332715454
1663	NC_015508	CGA	2	6	84482	84487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715454
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1666	NC_015508	TCG	2	6	84530	84535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715454
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1670	NC_015508	GA	3	6	84641	84646	50 %	0 %	50 %	0 %	332715454
1671	NC_015508	CGA	2	6	84659	84664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715454
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1673	NC_015508	CTG	2	6	84722	84727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715454
1674	NC_015508	CGT	2	6	84783	84788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715454
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1683	NC_015508	TCGTC	2	10	85542	85551	0 %	40 %	20 %	40 %	332715454
1684	NC_015508	TGC	2	6	85605	85610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715454
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1700	NC_015508	CAT	2	6	86397	86402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715454
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1703	NC_015508	CCT	2	6	86520	86525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715454
1704	NC_015508	TCG	2	6	86618	86623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1737	NC_015508	T	6	6	88277	88282	0 %	100 %	0 %	0 %	332715457
1738	NC_015508	AGAA	2	8	88302	88309	75 %	0 %	25 %	0 %	332715457
1739	NC_015508	GAT	2	6	88397	88402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715457
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1742	NC_015508	GGCT	2	8	88467	88474	0 %	25 %	50 %	25 %	332715457
1743	NC_015508	TCA	2	6	88594	88599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715457
1744	NC_015508	TTG	2	6	88612	88617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1745	NC_015508	AAT	2	6	88656	88661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1746	NC_015508	ACA	2	6	88693	88698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1747	NC_015508	GAG	2	6	88728	88733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1748	NC_015508	CGG	2	6	88904	88909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715458
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1750	NC_015508	GTC	2	6	88939	88944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715458
1751	NC_015508	AGG	2	6	88966	88971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715458
1752	NC_015508	ACCAC	2	10	89044	89053	40 %	0 %	0 %	60 %	332715458
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1754	NC_015508	CGGC	2	8	89086	89093	0 %	0 %	50 %	50 %	332715458
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1993	NC_015508	AT	3	6	101009	101014	50 %	50 %	0 %	0 %	332715472
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1998	NC_015508	TCT	2	6	101378	101383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715473
1999	NC_015508	ATC	2	6	101412	101417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715473
2000	NC_015508	GAC	2	6	101486	101491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715473

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